Kako diagnosticirati bakterijske bolezni

Metoda vizualne analize simptomov

Bakteričnih bolezni ni mogoče določiti z vizualno metodo, v večini primerov. Možno je le v primerih, ko so simptomi specifični. Prisotnost eksudata pogosto kaže na bakterijsko naravo nekroze..

Metoda mikroskopske analize obarvanja

Zdravilo je pripravljeno iz tkiv, ki so med zdravim in obolelim tkivom. Zaradi obarvanja (na primer po Gramu) omogoča prepoznavanje bakterijskih celic v tkivu gostiteljske rastline.

Mikrobiološka metoda

Povzročitelj je izoliran iz obolelega tkiva rastline in gojen na umetnem hranilnem mediju. Samo v tem primeru je treba ugotoviti patogenost bakterijskih izolatov, to je sposobnost povzročitelja, da na rastlinah, ki so umetno okužene, povzroči enake simptome, ki so bili na rastlini v preiskavi posledica naravne škode. Se pravi, da delujejo v skladu s pravilom Roberta Kocha, ki mu pravijo Kochova triada. Metoda je sestavljena iz treh stopenj: izolacija patogena, okužba rastline in izolacija patogena iz nje.

Serološka metoda

Bistvo metode je enako kot pri diagnozi virusov. Razlike v serološki diagnozi bakterij od diagnoze virusov so, da imajo poleg beljakovin, ki so značilne za vrsto, bakterijske celice tudi beljakovine, ki so skupne rodu in družini bakterij. Zato se za pridobitev specifičnega antiseruma uporabljajo samo proteini ali antigeni, specifični za vrsto. Najbolj priljubljene serološke metode so encimsko-imunski absorbentni test in imunofluorescenčna reakcija. Dandanes obstajajo cenovno ugodni dianogostični kompleti, s katerimi lahko prepoznate okužbo paradižnikovih semen z bakterijskim rakom.

Molekularna metoda

Med diagnostičnimi metodami, ki temeljijo na uporabi polimorfizma molekule DNK, so najpogostejše amplifikacija vrst specifičnih vrst DNA med verižno reakcijo polimeraze (PCR). Metoda temelji na sintezi ("razmnoževanju") posameznih fragmentov DNK, značilnih samo za eno vrsto bakterij. Odlomek DNK lahko "množimo" več sto, tisoč in milijonov krat, vse je odvisno od posebnosti določene vrste diagnoze. Nadalje se fragment odkrije z elektroforezo gela z agarozo ali s fluorescenco začetne raztopine.

Metoda je precej občutljiva (10–11 g bakterijske DNK bo dovolj za diagnozo), hitra (5-8 ur), visoko zanesljiva, natančna (100). Pomanjkljivosti je mogoče pripisati le visokim stroškom reagentov in opreme, kar pomeni visoke stroške same diagnoze. Za diagnozo bakterij s PCR je pomembno tudi, da najprej preučimo raznolikost DNK.